Essa foi uma revolta de caráter popular e não elitista, como foi a revolta mineira.
Em 12 de Agosto de 1798, os revoltosos espalharam vários panfletos pelas ruas de Salvador, na tentativa de inflamar a população contra Portugal, contra a escravidão e a favor da democracia. Os revoltosos baianos atacavam radicalmente o domínio português e lutavam por um modelo de governo francês a partir da Revolução Francesa.
A Conjuração Baiana também ficou conhecida como a Revolta dos Afaiates, pois seus principais líderes eram alfaiates e tinham o apoio de grande parte da população de Salvador. Mas, a revolta não teve sucesso, e foi duramente reprimida e seus principais líderes: João de Deus Nascimento, Luiz Gonzaga das Virgens e Veiga, Lucas Dantas do Amorim Torres e Manoel Faustino dos Santos Lira, foram condenados e executados em 9 de Novembro de 1799.